V posledných desiatich rokoch sa výskum endotoxínu zameral najmä na biosyntézu lipidov E. coli K-12.

V procese biosyntézy bunkového povrchu je UDP-N-acetylglukózamín (UDP-GlcNAc) dôležitým medziproduktom a spoločným prekurzorom peptidoglykánu a lipidu A, ktorý hrá dôležitú úlohu pri syntéze povrchových polysacharidov. V jadre LPS hrajú polysacharidy a О CleNAc kľúčovú úlohu pri väzbe antigénu.

UDP-GlcN a nosičový proteín kyseliny β-hydroxytetradekanovej ( β- Prekurzorové molekuly syntézy lipidu A, ako je hydroxymyristoyl-acylový nosičový proteín, hydroxymyristoyl-ACP), vytvárajú lipid A prostredníctvom nasledujúcich sérií reakcií:

1. Vznik UDP - monoacylacetylglukosamínu

UDP-GlcNAc je β-hydroxytetradekanová-apolipoproteín β Acyláciou kyseliny hydroxytetradekánovej vzniká UDP-3-monoacyl-GleNAc. Táto reakcia je katalyzovaná acyltransferázou. Gén lax A umiestnený na 4 minútach chromozómu kóduje acyltransferázu.

2. Produkcia UDP-2, 3-diacylglukozamínu a lipidu X

UDP-monoacylacetylglukózamín sa deacetyluje na aminoskupine za katalýzy N-deacetylázy kódovanej génom lpxC a potom sa prenesie na aminoskupinu za katalýzy produktu kódovaného génom lpxD kyseliny β-hydroxytetradekanovej, čím sa vytvorí UDP - diacylglukózamín (UDP - 2, 3 - diacyl - GlcN). UDP z UDP-lipoacylglukózy sa odstraňuje pyrofosfatázou za vzniku 1-fosfo-2,3-dilipoacylglukózamínu, ktorý je bežne známy ako lipid X (lipid x).

3. Tvorba lipidov Ⅳ a

UDP-2, 3-diacylglukosamín a lipid X prechádzajú cez β- 1,6-pyrofosfátová väzba je spojená a kondenzovaná za vzniku lipidového skeletu. V tomto čase sú v každej cukrovej skupine 2 kyselina β-hydroxytetradekánová, redukujúca glukozamín, má fosfátovú skupinu v polohe C-1. Táto reakcia je katalyzovaná proteínom kódovaným génom lpxB. Potom sa za katalýzy špecifickej kinázy fosforyluje poloha C-4 neredukujúceho glukozamínu za vzniku disacharidu 1,4'-difosfáttetradecylglukózamínu, konkrétne lipidu Ⅳa (lipid Ⅳa).

4. Produkcia lipidu A

Prechod z lipidu Ⅳa na lipid A vyžaduje pridanie KDO v polohe C-6' neredukujúceho glukozamínu a potom pridanie dvoch nasýtených mastných kyselín a polárnych skupín, ako je fosfát. Konkrétny mechanizmus tejto reakcie je zatiaľ nejasný.