Syntéza jadrového polysacharidu začína z lipidu Ⅳa. Po pridaní KDO (jadrový oligosacharid) v polohe C-6 neredukujúceho glukozamínu sa postupne pridáva heptóza a hexóza

1. Syntéza a adhézia KDO

Syntéza KDO zahŕňa tri kontinuálne reakcie: ① 5-fosfát D-ribóza ↔ 5-fosfo-D-arabinóza. ② 5-fosfát - D-arabinóza fosfoenolpyruvát → 8-fosfát - KDO fosfát. ③ 8-fosfát - kyselina alkánová KDO. Tieto tri reakcie sa uskutočnili za katalýzy 5-fosfo-D-nukleát izomerázy, 8-fosfor-KDO syntetázy a 8-fosfatázy. Detský gén umiestnený v 27. minúte chromozómu kóduje 8-fosfor-KDO syntetázu.

KDO generuje CMP-KDO aktivovanú formu za katalýzy CMP-KDO syntetázy. Enzým, ktorý katalyzuje túto reakciu, je kódovaný génom kds B umiestneným v 85. minúte chromozómu. CMP-KDO viaže KDO na C-6' lipidu Ⅳa za katalýzy dvojfunkčného alebo trojfunkčného proteínu WaaA a potom pridá druhú molekulu KDO k prvej molekule KDO.

2. Syntéza heptózových a hexózových oblastí

Heptóza sa pridáva do jadrového polysacharidu jeden po druhom vo forme aktivácie ADP a hexóza vo forme aktivácie UDP. Glykozyltransferázy, ktoré katalyzujú nukleotidové monosacharidy, patria do série membránovo príbuzných glykozyltransferáz, ktoré prenášajú cukrové skupiny na zrelé molekuly lipidu A na cytoplazmatickom povrchu bunkovej membrány. Syntetizovaná jadrová molekula lipidu A sa môže preniesť z cytoplazmatického povrchu bunkovej membrány na periplazmatický povrch bunkovej membrány za účasti transportného zariadenia ABC [ATP-binding cassette (ABC) transportér] a dokončiť spojovaciu reakciu s polysacharidovým reťazcom O antigénu na periplazmatickom povrchu, aby sa vytvorila kompletná molekula LPS. Okrem toho sa jadro lipidu A môže použiť aj ako receptor bežného enterobakteriálneho antigénu (ECA) a polysacharidového reťazca kapsulárneho K antigénu skupiny Escherichia coli.

Glykozyltransferázy alebo modifikujúce enzýmy zapojené do syntézy základných polysacharidov sú kódované triedou génov nazývaných wa ※ ※, ktoré sa nachádzajú na 81-82 minútach chromozómu medzi génmi cysE a pyrE a tieto gény sú distribuované v troch operónoch. . Pre päť základných štruktúr Escherichia coli je zloženie génov a genetická distribúcia rôznych syntéz jadra odlišné.

Operón waaA obsahuje štruktúrny gén waaA kódujúci bifunkčnú alebo trifunkčnú transferázu KDO a polypeptidový gén s neznámou funkciou a relatívnou molekulovou hmotnosťou 18 000. Produkty génov gmhD, waaF a waaC v operóne gmhD súvisia so syntézou heptózovej oblasti jadra, zatiaľ čo operón waaQ súvisí so syntézou vonkajšej hexózovej oblasti a chemickou modifikáciou jadrovej oblasti. V Escherichia coli K-12 je transkripcia gmhD operónu regulovaná promótorom tepelného šoku a transkripcia toho, ktorý operón je pozitívne regulovaná neprekladanou oblasťou upstream od operónu a transkripčným elongačným faktorom RfaH.