LBP (lipopolysaccharide-binding protein) je glykoproteín s relatívnou molekulovou hmotnosťou 60000. Jeho proteínová štruktúra je jednoreťazcový polypeptid s relatívnou molekulovou hmotnosťou 5000. V Golgiho tele podlieha glykozylačnej reakcii a vylučuje sa do krvi po zrelosti stať sa glykoproteínom. LBP nie je odolný voči teplu a jeho aktivita je zvyčajne stabilná pri 50 ℃ a približne 50 % jeho aktivity sa stráca medzi 53 a 56 ℃. Keď sa myšacie sérum alebo myšací čistý LBP zahriali na 59 °C, aktivita sa úplne stratila. Ľudská plazma je citlivá na teplo. Najbežnejšia metóda inaktivácie komplementu (56 ℃, 30 min) môže viesť k 70 % strate biologickej aktivity LBP.

V súčasnosti bolo objasnené, že aminokyselinová sekvencia ľudského LBP proteínu je zrelý proteínový polypeptidový reťazec zložený z peptidu signálnej sekvencie s 25 aminokyselinovými zvyškami a 452 aminokyselinovými zvyškami. Na polypeptidovom reťazci sú štyri cysteíny a päť glykozylačných väzbových miest, ktoré sa nachádzajú na miestach 275-277, 325-327, 330-332361-363 a 369-371 polypeptidového reťazca. Proteínová štruktúra králičieho LBP je veľmi podobná štruktúre ľudí. Skladá sa tiež z hydrofóbneho polypeptidového reťazca zloženého z 26 aminokyselinových zvyškov a proteínového polypeptidového reťazca zloženého zo 456 aminokyselinových zvyškov. Jeho aminokyselinová sekvencia je vysoko homológna s ľudskou, pričom 69 % má rovnakú aminokyselinovú sekvenciu; Nukleotidová sekvencia je na 78 % konzistentná, ale obsahuje iba 2 cysteíny a 3 glykozylačné väzbové miesta, ktoré sa nachádzajú na 275-277, 325-327 a 361-363 miestach. Chemická priestorová konformácia LBP je stále nejasná, čo môže byť podobné ako BPI (baktericídny/permeabilitu zvyšujúci proteín).