Akonáhle je O antigénový polymér spojený s jadrom lipidu A, zastaví polymerizačnú reakciu. To znamená, že spojovacia reakcia môže ukončiť polymerizačnú reakciu. Jadro lipidu A aj lipopolysacharid s rôznou dĺžkou opakujúcich sa jednotiek môžu byť účinne prenesené na vonkajšiu membránu. Preto je možné pomocou SDS-PAGE zistiť veľkosť molekuly lipopolysacharidu, čo je spôsobené skôr rozdielom v systéme biosyntézy než faktorom výstupného systému.

Distribúcia bočného reťazca O antigénu v rôznych baktériách je odlišná, niektoré z nich obsahujú približne 20 opakujúcich sa jednotiek a niektoré z nich môžu mať približne 100 opakujúcich sa jednotiek. Pri elektroforéze SDS-PAGE sa odráža rozdiel v intenzite farbenia striebrom rôznych molekúl rôznych druhov baktérií. Dôvodom rozdielnej distribúcie dĺžky bočného reťazca O antigénu v rôznych baktériách môže byť to, že v procese polykondenzácie alebo spojovacej reakcie O antigénu existuje faktor selekcie veľkosti. Wzz (t.j. Rol alebo Cld) je dôležitý proteín, ktorý reguluje distribúciu dĺžky bočného reťazca v baktériách, ktoré syntetizujú antigény prostredníctvom Wzy dependentnej dráhy, ale jeho špecifický mechanizmus je stále nejasný.